從開始的根瘤菌菌劑到細菌肥料，再到如今的生物肥料，這一名稱的演變說明了我國生物肥料的逐步發展過程。目前，我國生物肥料的生產已不能與同期化肥的產量和消費量相比，但已開始在農業生產中發揮作用，并取得了一定的經濟效益和社會效益。

　　隨著研究和應用的發展，生物肥料新品種的開發也應不斷擴大。將由單一菌株轉變為復合菌株。在這一轉化過程中，一是既要追求營養元素供給水平的提高，又要追求抗病、避蟲等多種功能，增強作物抗病能力，減少化學農藥的使用。

　　我們可以在原有的基礎上進一步提高部分或多個菌株的性能，使復雜或組合菌株發揮互惠、協調、共生、強化和同一的作用，消除相互對抗的發生。還要延長微生物在土壤中的存活時間，存活時間越長，生物肥料的比效期越長。

　　微生物在土壤中的存活時間主要取決于土壤中的有效碳源水平。在生物肥料中添加一株能分解土壤中碳化合物的菌株，可以不斷補充其他微生物碳源的營養，延長微生物在土壤中的存活時間。